MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 1893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017959	TTG	2	6	26	31	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389875180
2	NC_017959	GAG	2	6	76	81	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389875180
3	NC_017959	GCCC	2	8	164	171	0 %	0 %	25 %	75 %	389875180
4	NC_017959	CAC	2	6	195	200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875180
5	NC_017959	CCG	2	6	222	227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875180
6	NC_017959	CGA	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875180
7	NC_017959	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389875180
8	NC_017959	CGC	2	6	297	302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875180
9	NC_017959	GCAC	2	8	422	429	25 %	0 %	25 %	50 %	389875180
10	NC_017959	CGGG	2	8	459	466	0 %	0 %	75 %	25 %	389875180
11	NC_017959	C	6	6	535	540	0 %	0 %	0 %	100 %	389875180
12	NC_017959	GCT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875180
13	NC_017959	G	6	6	578	583	0 %	0 %	100 %	0 %	389875180
14	NC_017959	GGC	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875180
15	NC_017959	CG	4	8	591	598	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
16	NC_017959	TGCG	2	8	608	615	0 %	25 %	50 %	25 %	389875180
17	NC_017959	GCT	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875180
18	NC_017959	ATCT	2	8	685	692	25 %	50 %	0 %	25 %	389875180
19	NC_017959	GAT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875180
20	NC_017959	ACCGGC	2	12	811	822	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875180
21	NC_017959	GC	3	6	826	831	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
22	NC_017959	CCGTG	2	10	933	942	0 %	20 %	40 %	40 %	389875180
23	NC_017959	AGA	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389875180
24	NC_017959	CGA	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875180
25	NC_017959	CGA	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875180
26	NC_017959	CG	4	8	1068	1075	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
27	NC_017959	CGA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875180
28	NC_017959	GC	3	6	1110	1115	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
29	NC_017959	GCAG	2	8	1136	1143	25 %	0 %	50 %	25 %	389875180
30	NC_017959	CGG	2	6	1148	1153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875180
31	NC_017959	CGG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875180
32	NC_017959	GAG	2	6	1168	1173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389875180
33	NC_017959	ATG	2	6	1174	1179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875180
34	NC_017959	CCGG	2	8	1494	1501	0 %	0 %	50 %	50 %	389875181
35	NC_017959	GCACCG	2	12	1658	1669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875181
36	NC_017959	GTT	2	6	1710	1715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389875181
37	NC_017959	CCG	2	6	1724	1729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875181
38	NC_017959	TCT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389875182
39	NC_017959	TCA	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875182
40	NC_017959	GC	3	6	1793	1798	0 %	0 %	50 %	50 %	389875182
41	NC_017959	GGT	2	6	1822	1827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875182
42	NC_017959	CAG	3	9	1834	1842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875182
43	NC_017959	TCGG	2	8	1936	1943	0 %	25 %	50 %	25 %	389875182
44	NC_017959	TCC	2	6	1946	1951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389875182
45	NC_017959	TGA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875182
46	NC_017959	GCC	2	6	2005	2010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875182
47	NC_017959	CGA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875182
48	NC_017959	CGG	3	9	2088	2096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875182
49	NC_017959	CGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875182
50	NC_017959	CGT	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875183
51	NC_017959	CGA	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875183
52	NC_017959	CGGT	2	8	2310	2317	0 %	25 %	50 %	25 %	389875183
53	NC_017959	CGG	2	6	2347	2352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875183
54	NC_017959	GCGA	2	8	2517	2524	25 %	0 %	50 %	25 %	389875183
55	NC_017959	GCA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875183
56	NC_017959	CGC	2	6	2630	2635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875183
57	NC_017959	GGCG	2	8	2644	2651	0 %	0 %	75 %	25 %	389875183
58	NC_017959	GCC	2	6	2702	2707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875183
59	NC_017959	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875183
60	NC_017959	GGT	3	9	2756	2764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875183
61	NC_017959	GAC	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875183
62	NC_017959	CGT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875183
63	NC_017959	GC	3	6	2862	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	389875183
64	NC_017959	ACC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875183
65	NC_017959	CAC	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875183
66	NC_017959	GTC	3	9	2975	2983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875183
67	NC_017959	GCG	2	6	3042	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875183
68	NC_017959	GAC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875183
69	NC_017959	CG	3	6	3134	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	389875183
70	NC_017959	GTC	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875183
71	NC_017959	CGT	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875183
72	NC_017959	GTC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875183
73	NC_017959	GGC	3	9	3251	3259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875183
74	NC_017959	TTC	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389875183
75	NC_017959	CGG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875183
76	NC_017959	CCG	2	6	3274	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875183
77	NC_017959	GGC	2	6	3299	3304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875183
78	NC_017959	CAT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875184
79	NC_017959	TCA	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875184
80	NC_017959	GGTC	2	8	3617	3624	0 %	25 %	50 %	25 %	389875184
81	NC_017959	AGG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389875184
82	NC_017959	AGC	3	9	3654	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875184
83	NC_017959	TCG	3	9	3667	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875184
84	NC_017959	GCT	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875184
85	NC_017959	GCC	2	6	3774	3779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875184
86	NC_017959	TG	3	6	3816	3821	0 %	50 %	50 %	0 %	389875184
87	NC_017959	CGG	2	6	3854	3859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875184
88	NC_017959	GCCA	2	8	3903	3910	25 %	0 %	25 %	50 %	389875184
89	NC_017959	GGC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875184
90	NC_017959	CAC	2	6	4013	4018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875184
91	NC_017959	GAT	2	6	4064	4069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875184
92	NC_017959	GC	3	6	4104	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	389875184
93	NC_017959	CT	3	6	4229	4234	0 %	50 %	0 %	50 %	389875184
94	NC_017959	GAGC	2	8	4253	4260	25 %	0 %	50 %	25 %	389875184
95	NC_017959	GGC	2	6	4283	4288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875184
96	NC_017959	CG	3	6	4337	4342	0 %	0 %	50 %	50 %	389875184
97	NC_017959	TGT	3	9	4345	4353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389875184
98	NC_017959	GC	3	6	4407	4412	0 %	0 %	50 %	50 %	389875184
99	NC_017959	ATGC	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	389875184
100	NC_017959	ACG	2	6	4489	4494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875184
101	NC_017959	CGA	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875185
102	NC_017959	GCAG	2	8	4761	4768	25 %	0 %	50 %	25 %	389875185
103	NC_017959	CG	3	6	4780	4785	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
104	NC_017959	CGT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875185
105	NC_017959	CCG	2	6	4880	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875185
106	NC_017959	CGG	2	6	4908	4913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875185
107	NC_017959	CCGTGA	2	12	4966	4977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875185
108	NC_017959	CAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875185
109	NC_017959	AG	3	6	5013	5018	50 %	0 %	50 %	0 %	389875185
110	NC_017959	CCA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875185
111	NC_017959	CAG	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875185
112	NC_017959	CCGG	2	8	5110	5117	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
113	NC_017959	TCA	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875185
114	NC_017959	GGCC	2	8	5143	5150	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
115	NC_017959	GCGGGC	2	12	5153	5164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875185
116	NC_017959	CGGA	2	8	5183	5190	25 %	0 %	50 %	25 %	389875185
117	NC_017959	GTC	2	6	5195	5200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875185
118	NC_017959	TCG	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875185
119	NC_017959	CAG	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875185
120	NC_017959	CAG	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875185
121	NC_017959	GCG	2	6	5392	5397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875185
122	NC_017959	GGC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875185
123	NC_017959	TCG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875185
124	NC_017959	CTC	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389875185
125	NC_017959	GGT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875185
126	NC_017959	GCGAT	2	10	5558	5567	20 %	20 %	40 %	20 %	389875185
127	NC_017959	ATC	3	9	5583	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875185
128	NC_017959	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875185
129	NC_017959	GGT	2	6	5636	5641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875185
130	NC_017959	CGC	2	6	5737	5742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875185
131	NC_017959	GCCG	2	8	5783	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
132	NC_017959	CGGC	2	8	5827	5834	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
133	NC_017959	GGCC	2	8	5869	5876	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
134	NC_017959	GTC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875185
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261	NC_017959	CCG	2	6	11389	11394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875190
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263	NC_017959	GCC	3	9	11541	11549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875191
264	NC_017959	GCC	2	6	11562	11567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875191
265	NC_017959	CGG	2	6	11645	11650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875191
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